黃京飛等類物質轉運蛋白結合機制差異研究獲進展

【資料簡介】

黃京飛等類物質轉運蛋白結合機制差異研究獲進展
         近日，雜志PLoS One在線刊登了中科院昆明動物研究所研究人員的研究成果“Retinoid-Binding Proteins: Similar Protein Architectures Bind Similar Ligands via Compley Different Ways，”，文章中，研究者在類物質轉運蛋白結合機制差異研究中獲進展。

在進化過程中，相似的蛋白結構可以用*不同的方式結合相同的配體。類轉運蛋白就是一個很好的例子。雖然他們結合相似的配體（，），配體的結合機制卻差別很大：在同一個家族和細胞位置的蛋白中配體結合方向相同；不同家族和細胞位置蛋白中配體結合方向相反。

在FABP家族中，CRBPs和CRABPs的配體都是β紫羅酮環指向轉脂蛋白疏水桶的內部，而不飽和脂肪酸鏈指向溶液的方向。而在RBP家族RBP和ERABP蛋白中，配體方向剛好相反。結構比對和序列比對發現，每個蛋白的配體連接位點非常保守。但是不同蛋白間配體結合位置發生了改變，并且和配體連接的氨基酸在不同蛋白中都不保守。

中科院昆明動物研究所黃京飛課題組張玉茹博士和趙玉琦博士運用生物信息學和分子動力學模擬的方法，詳盡解釋了這種生物學現象并進一步提出了類物質在生物體內可能的轉運模型。（