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        PCR反應(yīng)體系內(nèi)部因素

        2025-5-6  閱讀(25)

          一個PCR反應(yīng)過程分為很多的步驟,包括樣本采集,運輸,核酸提取,qpcr擴增等步驟,因此結(jié)果會受到很多因素的影響,本文將常見因素分為內(nèi)部因素和外部因素,內(nèi)部因素是指正常試劑體系中的成分,外部因素是指環(huán)境或者樣本帶入的因素。
         
          體系內(nèi)部因素:
         
          1、引物:長度、擴增跨度、特異性等因素;
         
          2、酶及其濃度:酶濃度過高可引起非特異性擴增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少;
         
          3、dNTP的質(zhì)量與濃度:dNTP溶液呈酸性,一般配置成體系需將其調(diào)節(jié)至7.0-7.5,正常情況下4種dNTP的濃度應(yīng)該相等,如果其中某一種過高就會引起錯配,濃度過低又會引起PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量。不過目前使用的都是商品化配置好的預(yù)混液體系;
         
          4、模板核酸:模板核酸的量和純度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,對于RNA模板更要注意RNA的降解;
         
          5、Mg2+濃度:主要影響PCR擴增的特異性和產(chǎn)量,Mg2+濃度過高,反應(yīng)特異性降低,出現(xiàn)非特異性擴增,濃度過低會降低Taq 酶的活性,使反應(yīng)產(chǎn)物減少;
         
          6、溫度與時間的設(shè)置:變性溫度與時間、退火溫度與時間、延伸溫度與時間;
         
          7、循環(huán)次數(shù):循環(huán)次數(shù)決定PCR擴增程度,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。一般溫度循環(huán)次數(shù)在30-40次之間,循環(huán)次數(shù)越多,非特異性產(chǎn)物的量就越多。
         


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