高性能氣相色譜儀是根據載氣運動時氣固或氣液兩相之間的吸附或分配系數的不同來分離樣品中各組分的儀器。分離出的成分按照保留時間的順序進入檢測器，檢測信號被自動記錄。根據組分的保留時間和響應值進行定性和定量分析，主要由氣源、氣路控制系統、進樣系統、色譜柱、檢測器、電氣系統和記錄處理系統組成。
高性能氣相色譜儀調試完畢后，根據各單體的規定條件，調整氣相色譜儀的柱管、氣相色譜儀檢測器、溫度和載氣流量。進樣口的溫度一般應比色譜柱溫度高30-50。如果使用火焰離子化檢測器，其溫度應等于或高于色譜柱溫度，但不得低于100，以避免水蒸氣冷凝。色譜分析成分的峰位置用保留時間(從進樣液體到成分出現高峰的時間)和保留容量(保留時間載氣流速)表示。在某些條件下，這些可以反映物質特殊價值并相應地確定樣品的組成。
高性能氣相色譜儀經過加熱以后，要檢查色譜柱的連接情況和支架的固定是否牢固。以免由于溫度、振動等原因使色譜柱受擠壓或折斷。柱子折斷以后，請不要扔掉。若折斷的是兩端，長的一部分在一定范圍仍然可以得到很好的分離效果。如果折斷的是中間，經過一定程度的修復以后，仍然可以恢復使用功能。
當污染嚴重時，必須移除探測器進行清潔。該方法是除去收集器、極化電極、噴嘴等。如果噴嘴由應時材料制成，將其浸泡在水中過夜。如果噴嘴由不銹鋼，等材料制成，可以用300~400號細砂紙連同電極一起仔細打磨，噴嘴頂部穿入一個特殊的清潔細線束，插入并拉出數次，直到導線能夠平穩移動。然后用適當的溶劑(如1:1甲醇和苯)浸泡。也可以用超聲波清洗機清洗，用色譜級甲醇清洗，并在烘箱中干燥。
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