植物雌激素可視為人類和其他哺乳動物的外源性激素，直接參與機體的內分泌調節。一方面，一定劑量的植物雌激素在體內能夠與ER結合，發揮雌激素樣作用。Peterson等報道，植物雌激素中劑量時，可以產生一定的雌激素活性；高劑量時，可以活化因雌激素水平限制未能活化的ER，產生雌激素強效應；當植物雌激素使用足夠的劑量時，可以產生與體內17β雌二醇相似的效能。研究發現，食物中的植物雌激素在防治更年期綜合征、絕經后骨質疏松癥等方面有類似雌激素替代療法的積極作用。一些異黃酮在內源性雌激素相對缺少時具有雌激素效應，可以作為子宮切除后的代用品。歐洲已經人工合成了雌激素代用品*（ipriflavone）作為骨質疏松的治療藥物，其代謝產物之一為*。另一方面，低劑量的植物雌激素和內源性雌激素競爭性地與ER結合形成ER復合物，占據了受體結合部位，阻止了體內雌激素分子與受體相結合，因而有效地減弱了靶細胞對雌激素的應答，而起到了抗雌激素作用。染料木黃酮活性不足雌激素的千分之一，它與乳腺細胞的ER結合，競爭性占據ER位置，阻斷雌激素的作用。異黃酮與ER結合后，刺激性激素結合球蛋白的產生，并抑制*酶和雌激素合成酶的活性，從而減輕雌激素的促細胞增殖的作用。雌激素通過刺激細胞增生誘發癌癥，植物雌激素能夠通過雌激素拮抗作用減少乳腺癌和子宮癌的發生。
   Adlercreutz的研究表明，植物雌激素對乳腺癌、前列腺癌和結腸癌都有預防作用，這是因為植物雌激素與雌二醇競爭結合ER，從而抑制了雌二醇對腫瘤細胞的促分裂作用，抑制了腫瘤細胞的生長。植物雌激素還有抗氧化的作用，而自由基被認為與體內腫瘤的形成有關。
    Lephart ED研究顯示植物雌激素具有促進乳腺癌細胞增殖的作用，目前其機制尚未十分明確。有研究顯示，雌激素受體的兩種亞型ERα、ERβ和可能與之有關。兩種受體均分布于正常乳腺組織中，ERβ占有優勢，二者比例發生改變時，ERα數值升高可能導致腫瘤的發生。植物雌激素可能通過ERα途徑促進乳腺上皮細胞增殖，導致細胞惡變，形成腫瘤或者促進腫瘤細胞增生的[1]  。而且在1996年，有研究文獻稱，植物雌激素對正常人乳腺細胞有增生作用的報道[2]  。
    此外，植物雌激素對心血管系統具有良好的保護作用。如異黃酮與ER結合后，可以降低體內*的含量，減少心血管疾病如高*血癥、動脈硬化病變等的發生。
   植物雌激素具有雌激素激動劑和阻斷劑效應，對于婦女絕經后因雌激素減少引起的一些疾病以及激素相關疾病有較好的預防和治療作用。植物雌激素也有不利的一面，它會改變婦女的月經周期，大劑量的植物雌激素對于人的生育和發育都有不良影響。因此，我們尚需進行深入細致的探討，進行更多的臨床研究，以便科學合理地開發和利用植物雌激素。
    在植物雌激素與人體健康關系 研究中, 細胞培養、動物模型、人體實驗和營養流行病 學調查 研究結 果仍有 許多相互矛盾之處。一方面是因為在 細胞培 養中的 受試物 多采用植物雌激素提取物, 而在動物 模型和 人體實 驗多采 用含植物雌激素的食物如大豆 和亞麻 籽。食物成 分復雜, 所觀察到的結果中很可能有其它成分的作用。另 一方面, 結果還受 實驗設計、對 象選 擇和 觀察 例數 等 諸多 因素 影響。尤其是人體實驗, 有很多難以控制的影響因素。