MTBE會污染地下水源，日本的一家研究機構的研究也表明，汽油中的MTBE的含量超過7%，汽車排放中的氮氧化物會增加。因此，日本的無鉛汽油中，MTBE的加入量不超過7%。1996年美國Santa Monica市部分地區由于飲用水中MTBE含量太高，使得這些地區50%的供水系統關閉，這是引起公眾關注的MTBE污染事件。本品蒸氣或霧對眼睛、粘膜和上呼吸道有刺激作用，可引起化學性肺炎。對皮膚有刺激性。MTBE具有一定的毒性。20世紀80年代末開始研究其毒性。研究發現，它易于與水融合，可滲入土壤，破壞地下水質，認為它是一種可能的污染物。
MTBE主要經呼吸道吸收，也可以經皮膚和消化道吸收，動物在高濃度的MTBE中可致癌。對小鼠的麻醉濃度為1.0mmol/L，致死濃度為1.6mmol/L。對人體的影響主要表現在上呼吸道、眼睛粘膜的刺激反應，長期接觸可使皮膚干燥。目前，測定水質中MTBE的方法以吹掃捕集-氣質聯用為主，實驗建立了一種簡單、快捷、準確的分析方法來測定水質中的MTBE。
實驗儀器
GC5890N氣相色譜儀（南京科捷分析儀器有限公司）是利用*技術，整合國產儀器優點，進行技術革新，推出的全新一代網絡型實驗室氣相色譜儀。全兼容美國安捷倫6890N氣相色譜儀，可直接接駁安捷倫6890N氫火焰離子化檢測器、熱導檢測器、電子捕獲檢測器、火焰光度檢測器、氮磷檢測器及相關檢測器控制板；儀器技術指標、性能、檢測器靈敏度可與安捷倫6890N相媲美；可連接安捷倫色譜工作站和自動進樣器。
樣品前處理：取4mL含MTBE的水樣于頂空瓶，加塞密封，于恒溫水浴箱中平衡一定時間，用50μL進樣器抽取液上氣體（30μL）迅速進樣。
色譜條件（參考）：
| 色譜柱 | RTX-wax（30m×0.25mm，0.25μm） |
| 檢測器 | FID，220℃ |
| 汽化室 | 200℃ |
| 柱溫 | 柱溫80℃，保持3min，然后以10℃/min升到200℃，保持2min |
| 進樣量 | 30μL，10:1 |
| 載氣 | 1.0ml/min |
