大型制藥純化水設備的工藝大致分成以下幾種:
1、原水→原水加壓泵→石英砂過濾器→活性炭過濾器→軟水器（可選）→保安過濾器→一級反滲透設備→無菌純水箱→純水增壓泵→紫外線殺菌器→微孔過濾器→EDI系統→無菌純化水箱→臭氧殺菌器→純化水增壓泵→臭氧殺菌器→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點
2、原水→原水加壓泵→石英砂過濾器→活性炭過濾器→軟水器（可選）→保安過濾器→級反滲透→純水箱→純水增壓泵→第二級反滲透→無菌純化水箱→臭氧殺菌器→純化水增壓泵→臭氧殺菌器→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點
3、原水→原水加壓泵→石英砂過濾器→活性炭過濾器→軟水器（可選）→保安過濾器→級反滲透機→純水箱→純水增壓泵→第二級反滲透→無菌純水箱→純水增壓泵→紫外線殺菌器→微孔過濾器→EDI系統→菌純化水箱→臭氧殺菌器→純化水增壓泵→臭氧殺菌器→紫外線殺菌器→微孔過濾器→用水點（原水水質電導率1000μS以上建議使用此工藝流程）
大型制藥純化水設備日常維護保養：
1、可分為運行期間和停運期間開展。在制藥純化水設備運行期間，應當制定周期計劃，定期檢查設備濾芯、膜元件使用情況，是否受污染，是否出現工作性能下降，以及記錄產水水質數據，根據實際情況進行加藥；在設備停運期間，應對反滲透膜定期低壓沖洗，以預防微生物滋生。尤其在高溫季節，應每班沖洗一次。設備停運期間應按照停運保護操作規程執行。
2、使用一段時間后，可能出現工作性能下降情況，因此，工作性能保養也是非常重要的，如果制藥純化水設備與初始系統相比，系統產水量明顯下降或者產水含鹽量明顯上升跡象，需要及時對反對反滲透膜清洗。
3、當設備發生高低壓報警時，用戶要重新啟動，應該做好各個功能單元的檢查工作，先是檢查保安過濾器到高壓泵之間的手動閥情況，是否開度過小了，還要檢查RO進水調節閥及濃排閥情況，確認這些閥門正常運行狀態，再按住高低壓報警復位按鈕，確保設備開啟后不被損壞。
4、另外，設備投入使用后一段時間后，用戶可能會發現反滲透膜污堵以及配件耗材失效，出水水質嚴重下降，此時可考慮原水水質變化原因，由于不同季節的水質不同，對出水水質有一定的影響。如果制備純化水的原水水質已發生變化，可適當調整工藝設計，確保穩定生產出符合相應質量標準的水。
